芽孢杆菌植酸酶基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 仇明 余晓红 封功能 许伟 邵荣
• 来源期刊: 食品科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 植酸酶基因 克隆 同源建模
• 年，卷（期）: 2011,（7）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 202-206
• 分类号: Q812
• 字数: 3831字
• 语种: 中文

摘要

采用PCR技术从Bacillus amyloliquefaciens DSM 1061中克隆到植酸酶的全长基因phyC(1152bp),并将该基因成功克隆到表达载体pET22b(+),经PCR鉴定和DNA测序证明,pET22b(+)-phyC重组质粒构建成功.将该酶的氨基酸序列在Swiss-prot数据中进行BLAST比对发现,该序列未见报道,其与来自Bacillus subtilis的植酸酶序列(Swiss-prot ID:031097)最相似,序列一致性为98.7%.分析可知该氨基酸序列在位点为128、144、153、257和370处分别变异为Ala、Ile、Ser、Pro和Lys.运用SignalP 3.0服务器对其信号肽进行预测,表明该酶N端1～26个残基可能是信号肽序列.运用SWISS-MODEL服务器进行同源建模,经PROCHECK V3.5软件对其Ramachandran plot、G-factor等进行评价,结果显示结构模型中的键长、键角及二面角的分布及结构合理.该基因已在GenBank上登录(登录号为HM747163).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	余晓红	盐城工学院化学与生物工程学院	38	259	8.0	14.0
2	邵荣	盐城工学院化学与生物工程学院	95	562	12.0	18.0
3	许伟	盐城工学院化学与生物工程学院	61	309	9.0	13.0
4	封功能	盐城工学院化学与生物工程学院	41	381	11.0	18.0
5	仇明	盐城工学院化学与生物工程学院	17	118	6.0	10.0