凡纳滨对虾TCP-1-eta基因的克隆及与耐寒性状的相关性

• 作者: 崔亮 彭金霞 李奎 殷勤 王志伟 谢达祥 陈晓汉
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 农学
• 关键词: 凡纳滨对虾 TCP-1-eta SNP 耐寒性状
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 页码范围: 168-174
• 分类号: S9
• 字数: 5652字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2011.00168

摘要

为研究凡纳滨对虾耐寒性状的分子机理,文章克隆了凡纳滨对虾的耐寒相关基因TCP-1-eta并对其与耐寒性状的关系进行了研究.首先,根据电子克隆所得序列设计引物,采用RT-PCR方法克隆得到长1 705bp的TCP-1-eta基因序列,其中包括1 629 bp的完整开放阅读框,编码542个氨基酸残基.然后,运用荧光定量PCR对TCP-1-eta墓因进行时空表达谱的分析:(1)组织表达分析结果显示,该基因在凡纳滨对虾肌肉组织中表达量最高;(2)不同低温处理下的表达结果显示,该基因在15℃开始呈上调表达,13℃时表达量最高;(3)13℃低温处理的表达结果显示,该基因在36 h内呈小幅上调表达,但 36 h后表达量显著升高,48 h表达量达到0h的150倍.进一步采用PCR-RFLP方法对216只凡纳滨对虾TCP-1-eta基因进行了SNP多态性检测,并将其与耐寒性状进行了关联分析.在该基因编码区第731碱墓上发现C/T突变,方差分析结果表明该位点的不同基因型与耐寒力指标CDH (Cooling-degree hours)值相关(P < 0.05),其中CC基因型的耐寒能力比TT基因型强.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李奎	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	73	382	11.0	16.0
2	王志伟	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	6	63	4.0	6.0
3	陈晓汉		13	118	6.0	10.0
4	彭金霞		5	41	3.0	5.0
5	殷勤		3	38	3.0	3.0
9	崔亮		3	36	3.0	3.0
10	谢达祥		3	36	2.0	3.0