基于线粒体D-loop区比较分析野生与养殖斜带髭鲷种群的遗传多样性

• 作者: 杨国华 梁日深 罗大极 邹记兴 钟山 陈竹
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 斜带髭鲷 线粒体基因组 D-loop 基因多态性
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 页码范围: 761-767
• 分类号: Q346+.5
• 字数: 4030字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1035.2011.00761

摘要

采集广东省深圳市南澳区野生斜带髭鲷Hapalogenys nitens (Richardson)和养殖斜带髭鲷各25个样本.通过设计特异性引物,采用PCR技术对该50个个体的mtDNA D-loop区全序列进行扩增,测序得到的序列进行比对,发现该50个序列长度变异较小,均在788-790 bp之间,野生型和养殖型区别不大.采用MEGA(version 4.0)和DnaSP(version 4.0)软件对序列进行分析,结果显示:50条序列中T、C、A和G碱基平均含量分别为29.9%、21.5%、35.2%和13.5%,其中A+T的含量(65.1%)显著高于G+C含量(34.9%),表现了明显的碱基偏倚.50个个体表现为26种单倍型,包括91个多态位点,单倍型间平均遗传距离为0.024,单倍型多态性(h)为0.958,核苷酸多态性(π)值为0.02277.研究表明,mtDNA D-loop区可以作为检测野生与养殖斜带髭鲷群体遗传多样性的有效分子标记,而广东省深圳市南澳区野生斜带髭鲷种群遗传多样性已经下降至中等水平.研究提示野生斜带髭鲷种群遗传多样性不容乐观,资源调查、种质维护与遗传评价有待深入.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邹记兴	华南农业大学动物科学学院	116	496	12.0	16.0
2	杨国华	武汉大学遗传学系	31	194	9.0	12.0
3	钟山	武汉大学遗传学系	22	98	5.0	9.0
4	梁日深	华南农业大学动物科学学院	16	97	6.0	9.0
5	罗大极	武汉大学遗传学系	5	34	3.0	5.0
6	陈竹	武汉大学遗传学系	3	25	2.0	3.0