链孢粘帚霉寄生核盘菌菌核相关基因的EST生物信息学分析

• 作者: 孙漫红 李世东 钟增明 高会兰
• 来源期刊: 中国生物防治学报
• 学科: 农学
• 关键词: 链孢粘帚霉 核盘菌 菌寄生 EST 寄生相关基因
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 207-213
• 分类号: S476.8|Q785|Q811.4
• 字数: 5280字
• 语种: 中文

摘要

链孢粘帚霉Gliocladium catenulatum是一种重要的菌寄生真菌,为了明确该菌与寄主核盘菌Sclerotinia sclerotiorum互作中参与菌寄生过程的功能基因,本实验室前期采用抑制消减杂交技术(SSH)构建了消减cDNA文库.本文从该库里随机挑选420个阳性克隆进行测序分析,结果表明克隆片段大小在200～600bp的序列占81.07%.去除载体和小于100bp的序列,获得391条有效序列,其平均长度为409bp.通过序列拼接得到181个单值基因(unigenes),其中包括27个重叠群(contigs)和154个单拷贝的ESTs(singletons).将得到的ESTs与NCBI非冗余蛋白数据库(NR)进行BLASTx分析,结果显示有38个基因的编码蛋白与已知功能的蛋白有较高的相似性,其中包括可能与生物防治功能相关的内切葡聚糖酶、脂滴包被蛋白、MFS转运蛋白、过氧化物酶等;有39条序列在NCBI数据库中未找到相似序列,可能为新基因;其他基因的编码蛋白与数据库中功能未知蛋白相似性高.本研究为明确与重寄生功能相关的基因奠定了基础.