蒺藜苜蓿EST-SSRs分布特征及标记的开发

• 作者: 屠德鹏 张栋 武自念 邱伟伟 雷艳芳 魏臻武
• 来源期刊: 草业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 蒺藜苜蓿 EST-SSRs 引物设计 标记开发
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 所属期刊栏目: 植物生产层
• 页码范围: 746-752
• 分类号: S551+.9|Q946-33
• 字数: 4294字
• 语种: 中文

摘要

利用蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)EST数据库开发新的EST-SSRs标记.分析EST-SSRs的分布特征.利用SSRIT软件对NCBI上公布的285 285条蒺藜苜蓿EST序列进行SSR序列的检测.共检测出6688个SSR序列.分布于6512个EST中.占整个EST数据库的2.28%.其中二核苷酸重复基元出现的频率最高,占总EST-SSRs的34.4%(2301条).其次是三核苷酸重复基元,占29.6%(1982条).4～6核苷酸重复基元所占比例均较小.利用Primer Premier 5.0随机设计100对EST-SSRs引物.PCR扩增结果表明,85对引物在蒺藜苜蓿RIL群体亲本A17和A20上有清晰的扩增条带,占合成引物总教的85%.在RIL-8群体中检测到29个EST-SSRs引物有多态性,占可扩增引物的34.1%.本研究开发了85个蒺藜苜蓿ESrr-SSRs新标记.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	魏臻武	扬州大学动物科学与技术学院扬州大学草业科学研究所	51	386	11.0	16.0
2	张栋	扬州大学动物科学与技术学院扬州大学草业科学研究所	2	24	1.0	2.0
3	邱伟伟	扬州大学动物科学与技术学院扬州大学草业科学研究所	4	73	3.0	4.0
4	武自念	扬州大学动物科学与技术学院扬州大学草业科学研究所	6	79	4.0	6.0
5	雷艳芳		4	34	2.0	4.0
6	屠德鹏	扬州大学动物科学与技术学院扬州大学草业科学研究所	1	23	1.0	1.0