嗜热四膜虫腺苷三磷酸结合盒转运蛋白ABCC10基因的可变剪切分析

• 作者: 熊杰 缪炜 袁冬霞 陆星亦
• 来源期刊: 动物学研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 嗜热四膜虫 ABC转运蛋白 可变剪切 实时荧光定量PCR NMD
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 605-610
• 分类号: Q959.117|Q513
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1141.2011.06605

摘要

哺乳动物中腺苷三磷酸结合盒转运蛋白(ATP-binding cassette transporter,ABCT)可通过可变剪切产生多种转录本,其中含有提前终止密码子(premature terminal codon,PTC)的转录本还可与无义介导的mRNA降解通路(nonsense-mediated mRNA decay,NMD)作用来调节蛋白的相关功能,但这些现象尚未在低等生物的ABCT研究中发现.该文以单细胞原生动物——嗜热四膜虫为对象,利用转录组数据发现ABCC10基因存在可变剪切,并产生两条转录本(SV1和SV2),其中SV2在第五个内含子处发生内含子保留事件,这段长49bp的序列使SV2发生移码并产生PTC.在构建NMD通路中关键因子UPF1基因的嗜热四膜虫敲降株的基础上,利用实时荧光定量PCR方法检测SV2的转录情况.结果显示:含有PTC的转录本SV2在UPF1敲降株中的转录水平相对于野生型显著增加,说明SV2可被NMD通路降解.这与高等动物中某些ABCC蛋白通过可变剪切引入含PTC转录本,并能被NMD降解的方式一致,推测该方式在真核生物中十分保守,并在真核生物的共同祖先(the last eukaryotic common ancestor)中就已形成.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	缪炜	中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室	29	266	10.0	16.0
2	陆星亦	中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室	2	0	0.0	0.0
6	熊杰	中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室	12	60	3.0	7.0
10	袁冬霞	中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室	7	7	1.0	2.0