三角帆蚌AMP基因cDNA全序列的克隆及分子特征研究

• 作者: 李家乐 汪桂玲 白志毅 董姝君
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 三角帆蚌 AMP基因RACE 分子特征
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 水产生物技术
• 页码范围: 342-349
• 分类号: S917
• 语种: 中文

摘要

以三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)为研究材料,根据实验室构建的三角帆蚌cDNA文库中已标注的EST序列,利用RACE克隆了三角帆蚌AMP基因的cDNA全序列.该cDNA序列全长为970 bp,5′端非翻译区123 bp,3′端非翻译区526 bp,开放阅读框(ORF)长为300bp,共编码99个氨基酸,包含一段由27个氨基酸组成的信号肽和72个氨基酸的成熟肽,分子量为10 924.7 u.氨基酸序列分析表明,该序列存在明显的跨膜结构和疏水区.同源性分析表明,该基因编码的蛋白与海兔(Aplysia californica)theromacin氨基酸序列的相似度最高为56%,而与贻贝等中发现的抗菌肽defensins、mytilins、myticins和mytimycins相似度较低,推测属于抗菌肽theromacin基因家族.Jpred3软件对三角帆蚌AMP蛋白的二级结构预测结果表明,在第2～22、57～62氨基酸残基处存在α螺旋,因此,三角帆蚌的AMP蛋白是包含跨膜螺旋的膜蛋白.为进一步研究该基因的表达、功能及三角帆蚌病害防御奠定了分子基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	白志毅	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	36	253	9.0	14.0
2	汪桂玲	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	33	196	9.0	12.0
3	董姝君	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	1	8	1.0	1.0