棕色棉F3'H-羟化酶基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 刘海峰 宋武 李晓波 李艳红 梁明炜 肖向文 陆雪莹 鲁春芳
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 农学
• 关键词: 类黄酮3′-羟化酶 棕色棉 RACE 序列分析
• 年，卷（期）: 2011,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 199-206
• 分类号: S562
• 字数: 6698字
• 语种: 中文

摘要

根据葡萄的类黄酮3′-羟化酶(F3'H)基因全长cDNA序列Blast所得棉花的EST序列设计引物,以开花后16 d(DPA16)的新彩棉5号(xC-5)纤维为材料,利用RACE和RT-PCR技术分离得到了2个类黄酮3′-羟化酶基因cDNA序列,此2个序列编码区完全相同,仅在3'UTR区存在片段长短的差异,推测可能是基因转录后加工方式不同所造成.克隆所获得的棉花F3'H基因编码区全长1 533 bp,编码510个氨基酸,氨基酸序列分析预测表明,该基因所编码蛋白含有一个跨膜结构域,是一种分泌蛋白,定位于内质网上,并含有一段与细胞色素P450功能区相匹配的保守功能域；序列比对结果表明,棉花F3'H基因与其他多个物种的F3'H基因在氨基酸序列上有较高的同源性；聚类分析结果表明,棉花F3'H蛋白与双子叶植物大豆的F3'H亲缘关系较为接近,而与单子叶植物高梁等作物则较远.