莱茵衣藻硫胁迫相关microRNA检测及其靶基因分析

• 作者: 胡章立 舒龙飞 苟德明
• 来源期刊: 深圳大学学报（理工版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 生物工程 分子生物学 莱茵衣藻 缺硫胁迫 小分子核糖核酸 实时定量反转录聚合酶链式反应
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 237-242
• 分类号: Q74
• 字数: 2983字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2618.2011.03.009

摘要

采用特异反转录引物,构建莱茵衣藻microRNA(miRNA)的cDNA文库.选用U4核仁小分子RNA(small nucleolar RNA,snoRNA)作为内参,用SYBR(R)green RT-PCR对3种与莱茵衣藻缺硫胁迫反应相关的miRNA进行检测,利用在线平台软件Web MicroRNAs Designer(WMD3)对miRNA靶基因进行预测.结果表明,在缺硫胁迫下,3种miRNA(miRNA1145.2、miRNA1146和miRNA1158)的表达水平均明显上调,与正常培养的莱茵衣藻表达miRNA的相对丰度比值分别为3.11、2.38和3.67.靶基因预测分析表明,miRNA1145.2能影响脂肪酸氧化反应,miRNA1146与辅酶Q代谢相关,miRNA1158可能参与磷酸戊糖途径调控.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡章立	深圳市海洋生物资源与生态环境重点实验室深圳大学生命科学学院	2	7	1.0	2.0
2	舒龙飞	深圳市海洋生物资源与生态环境重点实验室深圳大学生命科学学院	1	6	1.0	1.0
3	苟德明	深圳市海洋生物资源与生态环境重点实验室深圳大学生命科学学院	1	6	1.0	1.0