鲢三、四核苷酸重复微卫星标记的筛选及其特征分析

• 作者: 孙效文 张天奇 李超 谭照君 鲁翠云
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鲢 微卫星 三核苷酸和四核苷酸重复序列
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 水产生物技术
• 页码范围: 328-335
• 分类号: S917
• 语种: 中文

摘要

通过磁珠富集法筛选鲢(Hypophthalmichtys molitrix)的三、四核苷酸重复微卫星分子标记.提取鲢血液大片段基因组DNA,用限制性内切酶Sau3AI进行酶切,蔗糖密度梯度离心收集400～900bp长度的片段,构建鲢全基因组PCR文库,用生物素标记的微卫星探针(TGA)8、(CAG)8以及(AGAT)6进行筛选,磁珠富集含有微卫星序列的DNA片段,获得含有微卫星的单链序列;将这些序列通过PCR扩增,连接pMD 18-T载体,转入感受态大肠杆菌(Escherichia coli)DH5α,获得微卫星文库;再用γ-32P标记的放射性同位素探针进行二次杂交筛选,获得1 758个阳性克隆,选择测序348个克隆序列中,共含有280个微卫星座位,其中完美型167个(59.64%),非完美型28个(10%),混合型85个(30.36%).Primer 3.0软件设计60对引物,并用珠江水系的野生鲢群体对引物进行多态性位点检测.统计软件分析显示其中22对具有较高的筛选效率和多态性,可作为鲢种质评价等遗传分析的工具.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谭照君	大连海洋大学生命科学与技术学院	2	49	2.0	2.0
2	孙效文	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	159	3935	35.0	57.0
3	张天奇	大连海洋大学生命科学与技术学院	4	95	4.0	4.0
4	李超	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	31	177	7.0	11.0
5	鲁翠云	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	47	1092	18.0	32.0