基因挖掘软件GenCLip寻找强直性脊柱炎相关基因的研究

• 作者: 廖泽涛 李秋霞 魏秋静
• 来源期刊: 新医学
• 关键词: GenCLip 强直性脊柱炎 疾病相关基因
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 304-307
• 分类号: R394.8
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/g.issn.0253-9802.2011.05.009

摘要

目的:以强直性脊柱炎(AS)为例,分析探讨基因挖掘软件GenCLip用于寻找与疾病相关的基因的可行性.方法:根据全基因组cDNA芯片结果,在常规统计方法初筛得出的25个差异基因(AS与健康志愿者比较)的基础上,采用GenCLip寻找与AS相关的基因.结果:在用2个关键词Fibrosis、Inflammation创建网络时发现了2个新的与AS相关的基因RGS1和CCL3L3,它们和AS的炎症、纤维化网络相关,通过实时荧光定量法证实RGS1是一个未分化脊柱关节病(SpA)重要的生物标记,而CCL3L3在AS中的作用则有待进一步研究.结论:用GenCLip软件分析芯片结果寻找疾病相关基因可能是一个可行方法,建议推广应用以进一步验证其可靠性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李秋霞	中山大学附属第三医院风湿科	23	95	6.0	9.0
2	魏秋静	中山大学附属第三医院风湿科	38	189	6.0	12.0
3	廖泽涛	中山大学附属第三医院风湿科	19	128	6.0	11.0