临床标本中未知病毒基因芯片检测方法探索

• 作者: 夏文英 师永霞 幸芦琴 李小波 洪烨 王洪敏 郑夔 郭波旋 黄吉城
• 来源期刊: 华南预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 病毒,未分类 登革热病毒 全基因组扩增 基因芯片
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1-4,8
• 页数: 5页
• 分类号: R446.7
• 语种: 中文

摘要

目的 探索可用于检测临床标本中未知病毒的基因芯片技术.方法 设计合成1～4型登革病毒基因芯片探针,制备成登革病毒基因芯片.提取1～4型登革病毒标准毒株的核酸RNA,以phi29 DNA聚合酶结合带标签序列的随机引物进行全基因组扩增,再以Cy3荧光染料标记的标签序列引物进行PCR随机扩增标记,标记产物进一步用登革病毒芯片进行杂交检测,随后用广州白云机场出入境检验检疫局国境口岸收集的登革热病人血清标本对新建立的方法进行验证.结果 1～4型登革病毒标准毒株培养液提取的RNA,经扩增、标记及芯片杂交检测,相应探针阵列均可检测到明显杂交信号,探针阳性率均达100％；从3份临床登革热病人血清标本中提取的RNA,同样也可得到明显的杂交信号,而背景干扰信号很低,从相应达到100％探针阳性率的探针阵列可判断,3份病人血清标本中分别为含1、2、3型登革病毒.结论 该研究新建立的基因芯片方法,可用于检测临床血清标本中的登革病毒,如果设计更多针对不同病原体的特异性芯片探针,该方法还可用于临床标本中一些未知病原体的鉴定.