河南省2010年肠道病毒EV71型分离株全基因组序列分析

• 作者: 李幸乐 许汴利 许玉玲 陈豪敏 黄学勇
• 来源期刊: 郑州大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 手足口病 肠道病毒71型 测序 同源性分析
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 699-703
• 分类号: R373.2
• 字数: 3291字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-6825.2011.05.014

摘要

目的:了解2010年河南省流行的肠道病毒(EV)71型基因特征.方法:筛选2010年河南省分离的EV71型病毒株1株(EV71/Henan/DC/2010),进行全基因组序列测定和基因进化特性分析.结果:EV71/Henan/DC/2010与其他EV71病毒株相比,编码区无核苷酸的缺失或插入,5'UTR区和3'UTR区长度和序列有一定差异.核苷酸同源性比较显示,EV71/Henan/DC/2010与2008年北京暴发流行株同源性最高(99.2％),与安徽阜阳暴发流行株和河南省暴发流行株均具有很高的同源性(98.1％和99.1％);与EV71各亚型代表株的比较结果显示,除VP3区以外,EV71/Henan/DC/2010各区均与C4亚型代表株同源性最高;氨基酸同源性比较结果显示,EV71/Henan/DC/2010大多数核苷酸变异属无义突变,相应氨基酸并未随之发生改变.根据VP1区基因序列构建遗传进化分析树显示,EV71/Henan/DC/2010与C4亚型同属一个分支.结论:EV71/Henan/DC/2010与2008年北京EV71流行株亲缘关系最为接近,同属于C4亚型.与我省及我国既往流行毒株相比,未发生大的变异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	许汴利	河南省疾病预防控制中心传染病所	148	1187	16.0	24.0
2	李幸乐	河南省疾病预防控制中心传染病所	31	186	9.0	11.0
3	陈豪敏	河南省疾病预防控制中心传染病所	58	514	12.0	18.0
4	黄学勇	河南省疾病预防控制中心传染病所	93	505	10.0	17.0
5	许玉玲	河南省疾病预防控制中心传染病所	23	38	4.0	5.0