竹筴鱼属鱼类线粒体DNA控制区结构及其系统发育分析

• 作者: 江世贵 苏天凤
• 来源期刊: 南方水产
• 学科: 农学
• 关键词: 竹筴鱼属 线粒体 DNA 控制区 结构 系统发育
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 18-25
• 分类号: Q951|S917.4
• 字数: 5970字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-0780.2011.01.003

摘要

采用PCR产物直接测序法测定了2尾来自中国南海的日本竹筴鱼(Trachurus japonicus)线粒体DNA控制区基因全序列,并结合从GenBank中下载的8种竹筴鱼属相应序列,对竹筴鱼属控制区序列进行了结构分析,识别出终止序列区、中央区和保守序列区3个区域,并找到了2个与DNA复制终止相关的序列TAS和中央保守区的保守序列CSB-F、CSB-E和CSB-D,以及保守序列区的保守序列CSB1、CSB2和CSB3.以鳜(Siniperca chuatsi)作为外群,使用邻接法和最大简约法构建了9种竹筴鱼属的系统发育树.竹筴鱼属鱼类为单系类群,蓝竹筴鱼(T.picturatus)、智利竹筴鱼(T.murphyi)、太平洋竹筴鱼(T.symmetricus)、南非竹筴鱼(T.capensis)和竹筴鱼(T.trachurus)构成一支,地中海竹筴鱼(T.mediterraneus)、青背竹筴鱼(T.declivis)、日本竹筴鱼(T.japonicus)和新西兰竹筴鱼(T.novaezelandiae)为另一支;日本竹筴鱼未单独成一支,而是聚入青背竹筴鱼和新西兰竹筴鱼之间,初步猜测日本竹筴鱼和新西兰竹筴鱼为同种异名.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	苏天凤	中国水产科学研究院南海水产研究所	58	1015	17.0	29.0
2	江世贵	中国水产科学研究院南海水产研究所	100	1501	22.0	31.0