两种微孢子虫全基因组中密码子偏好性比较

• 作者: 向恒 周泽扬 张瑞芝 李田 潘国庆
• 来源期刊: 蚕学通讯
• 学科: 农学
• 关键词: 微孢子虫 密码子偏好性 比较基因组学
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 1-8
• 分类号: S884
• 字数: 3532字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-0561.2011.01.001

摘要

微孢子虫(Microsporidia)是一类细胞内营专性寄生的单细胞真核生物.基于其已测得的两个典型种的基因组数据,比较了家蚕微孢子虫(Nosema bombycis)与兔脑炎微孢子虫(Encephalitozoon cuniculi)之间全基因组的密码子偏好性异同.结果表明两基因组的密码子偏好性都较弱,基因表达程度都较低.而且二者之间确实存在显著差异,表现在兔脑炎微孢子虫的偏好性比家蚕微孢子虫的更弱,其最优密码子的偏好性也更弱,完全不同于家蚕微孢子虫偏向于使用第三位是A/U的最优密码子.这些差异与它们在核苷酸组成上的不同是一致的,有可能是两微孢子虫寄生于不同环境中导致了它们在密码子偏好性上的差异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周泽扬	西南大学蚕学与系统生物学研究所	59	388	9.0	17.0
2	潘国庆	西南大学蚕学与系统生物学研究所	44	197	8.0	11.0
3	李田	西南大学蚕学与系统生物学研究所	26	114	6.0	10.0
4	张瑞芝	西南大学蚕学与系统生物学研究所	5	20	2.0	4.0
8	向恒	西南大学蚕学与系统生物学研究所	8	31	4.0	5.0