黑线姬鼠OPN部分编码区结构与分子系统进化分析

• 作者: 徐来祥 薛慧良 赵文捷
• 来源期刊: 曲阜师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 数学
• 关键词: 黑线姬鼠 OPN 序列结构 系统进化
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 页码范围: 84-88
• 分类号: O175.12
• 字数: 3750字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-5337.2011.02.019

摘要

以近缘种OPN的cDNA序列为参考设计引物,通过RT-PCR得到黑线姬鼠OPN部分序列,并将得到的cDNA序列翻译成氨基酸序列,注册到GenBank(登陆号:HM626723).利用该序列构建系统进化树,同时对其编码的蛋白质进行一级结构分析及二级结构预测.结果表明:克隆得到的209 bp OPN的序列,包括部分外显子4,全部的外显子5及部分外显子6;该段序列从第二个碱基开始翻译,共编码69个氨基酸;其一级结构中包括了一个由10个连续天冬氨酸组成的高度酸性区域,它对骨桥蛋白与羟基磷灰石之间的联系具有重要意义;二级结构中大部分为а螺旋,且具有亲水性;利用所得OPN序列构建的系统进化树显示黑线姬鼠与大鼠、小鼠亲缘关系最近,与鸡、鹌鹑亲缘关系最远,此结果与物种的进化关系相一致,本研究所得到的OPN序列将有助于对骨桥蛋白的作用机制研究及系统进行分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐来祥	曲阜师范大学生命科学学院	95	654	12.0	22.0
2	薛慧良	曲阜师范大学生命科学学院	51	182	8.0	11.0
3	赵文捷	曲阜师范大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0