大鳍鳠免疫球蛋白M重链基因的克隆及表达分析

• 作者: 张其中 朱成科 李春涛 李超 杨莹莹 陈霞
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大鳍鳠 IgM重链基因cDNA 克隆 实时荧光定量PCR 组织分布
• 年，卷（期）: 2011,（11）
• 页码范围: 1684-1693
• 分类号: Q785|S917
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2011.17563

摘要

用RACE-PCR和RT-PCR方法获得大鳍鳠分泌型免疫球蛋白M(sIgM)重链基因的全长cDNA序列.大鳍鳠sIgM的cDNA全长为1 992 bp,包含5 '非编码区53 bp,3’非编码区226 bp,开放阅读框1 713,编码570个氨基酸.推测的大鳍鳠sIgM蛋白质序列可变区含有4个骨架区(FR)和3个互补决定区(CDR),恒定区(CH)含有CH1、CH2、CH3和CH4 4个部分.与其它6种硬骨鱼类IgM氨基酸序列比对分析表明,大鳍鳠sIgM存在半胱氨酸和色氨酸保守位点；其氨基酸序列与斑点叉尾鲴IgM的相似性最高,为54.3％；与石斑鱼的相似性最低,为24.6％.进化树分析表明,大鳍鳠sIgM与斑点叉尾鲴聚为一支.RT-PCR显示,大鳍鳠IgM基因主要在血细胞、脾脏、头肾和中肾中转录表达；注射嗜水气单胞菌后,血细胞、脾脏和头肾IgM重链基因转录表达量在1～10 d内有显著上升.