基于16S rRNA和16S-23S rRNA基因间隔区序列探讨陆生和水生螺原体菌株的系统发生关系

• 作者: 张晓君 毕可然 王文 阎斌伦 顾伟
• 来源期刊: 南京师大学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 螺原体 16S rRNA基因 16S-23S rRNA基因间隔区序列 系统发生关系
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 96-101
• 分类号: Q339.1
• 字数: 4196字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-4616.2011.01.020

摘要

采集江苏省养殖池塘内发病的中华绒螯蟹、克氏原螯虾和南美白对虾,利用已有螺原体16S rRNA和23S rRNA基因序列保守引物扩增并测序16S rRNA和16S-23S rRNA基因间隔区序列(ISRs).基于已获得的序列和GenBank中下载的螺原体序列分别进行同源性比对,比对的结果分别利用PAUP软件和MrBayes软件提供的最大似然法和贝叶斯法进行系统发生关系分析.分析结果是:所有淡水甲壳动物螺原体菌株Spiroplasma eriocheiris(中华绒螯蟹)、Spiroplasma sp.CRAYFISH(克氏原螯虾)、Spiroplasma sp.SHRIMP(南美白对虾)严格聚为一支,并且与陆生兔扁虱螺原体(非凡螺原体)Spiroplasma mirum关系最近,而与中国报道的陆生植物螺原体菌株Spiroplasma sp.CR-1(油菜)、Spiroplasma sp.CNR-1(油菜)、Spiroplasma sp.CNR-2(油菜)、Spiroplasma sp.CAN-1(杜鹃花)、Spiroplasma sp.CRW-1(红花酢浆草)及昆虫螺原体菌株Spiroplasma sp.CH-1(蜜蜂)、Spiroplasma sp.M10(蜜蜂)关系较远,此外,3个淡水甲壳动物螺原体菌株与现今唯一报道的海水南美白对虾螺原体Spiroplasma penaei系统发生关系也很远.因此,在螺原体属中,我国发现的淡水甲壳动物螺原体近缘种是非凡螺原体而不是我国陆生昆虫或植物螺原体及美洲的南美白对虾螺原体.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	阎斌伦	淮海工学院海洋学院江苏省海洋生物技术重点建设实验室	264	2463	24.0	36.0
2	张晓君	淮海工学院海洋学院江苏省海洋生物技术重点建设实验室	45	582	14.0	22.0
3	王文	南京师范大学生命科学学院江苏省生物资源技术和水生甲壳动物病害重点实验室	27	500	11.0	22.0
4	毕可然	淮海工学院海洋学院江苏省海洋生物技术重点建设实验室	25	202	8.0	13.0
5	顾伟	南京师范大学生命科学学院江苏省生物资源技术和水生甲壳动物病害重点实验室	6	41	3.0	6.0