三种室内饲养鱼类肠道微生物群落PCR-DGGE指纹分析

• 作者: 余育和 李学梅 董小林 解绶启 陈宇航 颜庆云
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 斑点叉尾鲴 银鲫 异育银鲫 PCR-DGGE 肠道微生物群落
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 页码范围: 423-429
• 分类号: Q145+.2|Q781
• 字数: 4363字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1035.2011.00423

摘要

以室内饲养的斑点叉尾鲴(Ictalurus punctatus)、银鲫和异育银鲫(中科三号)(Carassius auratus gibelio)幼鱼为对象,通过PCR-DGGE指纹技术对其肠道微生物群落进行了探索研究.在三种鱼的肠道中检测到不同的PCR-DGGE指纹谱带,其中斑点叉尾鲴的平均谱带数(7.5)相对于银鲫和异育银鲫的谱带数(分别为15和14)要少.基于PCR-DGGE指纹谱带及各谱带相对丰度的UPGMA聚类和MDS排序结果显示银鲫和异育银鲫肠道微生物相似性高,而与斑点叉尾鲴的差异比较大;rank-abundance散点图及回归分析也显示斑点叉尾鲴与银鲫、异育银鲫肠道微生物群落存在显著差异(P＜0.05),而银鲫和异育银鲫之间无显著差异(P=0.383).在斑点叉尾鲴肠道中检测到的菌群主要是变形杆菌,包括γ-变形杆菌和α-变形杆菌;而银鲫和异育银鲫肠道中菌群主要包括梭杆菌属中的类群,还包括变形杆菌门中的气单胞菌属,以及一些未知的类群.以上结果均表明在所研究的三种鱼的幼鱼阶段,其肠道微生物组成在不同种类鱼中存在差异,且该差异受基因型的影响可能更大.