水稻低温响应基因OsCR1的克隆与表达分析

• 作者: 夏新界 宋书锋 崔延春 徐国云 王曼玲
• 来源期刊: 激光生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 水稻 低温 芯片 克隆 表达谱
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 685-691
• 分类号: Q786
• 字数: 4338字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-7146.2011.05.021

摘要

低温、高温、干旱等非生物胁迫是影响水稻产量与品质的重要非生物逆境因子.为了探索水稻耐逆的分子机理并挖掘新的水稻耐逆基因,采用Affymetrix 60K水稻基因表达芯片分析了培矮64S全基因组在上述逆境下的表达谱变化,筛选出一个受低温诱导表达水平显著升高的基因OsCR1( Oryza sativaL.cold responsive gene 1,GenBank登录号:AK066066).实时定量PCR进一步证实该基因受低温诱导高表达.利用RT-PCR方法扩增获得其cDNA序列.生物信息学分析表明,OsCR1位于水稻第10号染色体上,包含两个内含子并存在选择性剪接现象,可编码含195个氨基酸残基的蛋白质,其蛋白等电点为5.78,分子量为21.9 kD.拓扑结构预测显示OsCR1蛋白上含有2个Ser/Thr蛋白激酶磷酸化位点；疏水性分析显示该基因为亲水性蛋白；启动子区域分析发现5类逆境相关的顺式作用元件.氨基酸序列比对分析显示OsCR1为未知功能基因.