葡萄中一类AP2/EREBP-B1亚族转录因子的电子克隆及生物信息学分析

• 作者: 姚泉洪 帅建军 彭日荷 熊爱生 田永生 郑建立 高峰 高建杰
• 来源期刊: 上海农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 葡萄 AP2/EREBP 电子克隆 转录因子 生物信息学
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 9-15
• 分类号: S663.1|Q785
• 字数: 5080字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-3924.2011.03.003

摘要

采用电子克隆(In silico cloning)的方法获得3个葡萄ERF类转录因子VvERF2.1、VvERF2.2、VvERF2.3,利用生物信息学方法对基因推导的氨基酸序列从氨基酸组成、理化性质、进化关系、高级结构和功能等方面进行了预测和分析.结果表明:3个转录因子属于AP2/EREBP-B1亚族,与其他物种的ERF在序列组成、结构及活性位点等方面具有高度的一致性.