锦葵科植物DNA条形码通用序列的筛选

• 作者: 刘震 王柯 陈士林 陈科力
• 来源期刊: 植物学报
• 关键词: DNA条形码 鉴定 ITS ITS2 锦葵科 psbA-trnH
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 276-284
• 分类号: Q949
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1259.2011.00276

摘要

对锦葵科植物样品的ITS、ITS2、rbcL、matK和psbA-tmH序列进行PCR扩增和测序,比较各序列的扩增效率、测序成功率、种内和种间变异的差异以及barcoding gap图,使用BLAST1和Nearest Distance方法评价不同序列的鉴定能力,进而从这些候选序列中筛选出较适合锦葵科植物鉴别的DNA条形码序列.结果表明,lTS序列在采集的锦葵科植物11个种26个样品中的扩增成功率较高,其种内、种间变异差异和barcoding gap较ITS2、psbA-tmH及rbcL序列具有更明显的优势,且.纳入60个属316个种共1 228个样品的网上数据后,其鉴定成功率可达89.9%.psbA-tmH序列的扩增和测序成功率最高,其鉴定成功率为63.2%,并能鉴别一些ITS序列无法鉴别的种.实验结果表明,ITS和psbA-trnH是较适合鉴别锦葵科植物的DNA条形码序列组合.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈科力	湖北中医药大学中药资源和中药复方教育部重点实验室	218	2163	24.0	32.0
2	刘震	湖北中医药大学中药资源和中药复方教育部重点实验室	4	76	4.0	4.0
3	陈士林	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	143	2855	29.0	43.0
4	王柯	湖北中医药大学中药资源和中药复方教育部重点实验室	4	48	3.0	4.0