大肠杆菌F18菌株敏感和抵抗基因型仔猪十二指肠基因表达谱差异分析

• 作者: 包文斌 叶兰 吴圣龙 朱国强 朱璟 杜子栋 潘章源 蔡家嘉 黄小国
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 大肠杆菌F18菌株 基因芯片 基因表达谱
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 60-66
• 分类号: S8
• 字数: 5398字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2011.00060

摘要

文章运用Agilent双标记表达谱芯片,基于已建立的苏太猪大肠杆菌F18菌株敏感性和抗性型全同胞配对个体,分析十二指肠组织基因表达谱差异,旨在筛选导致仔猪断奶后腹泻和水肿病发生的大肠杆菌F18菌株受体相关基因,探讨造成大肠杆菌病抗性和敏感性资源家系抗性差异的分子生物学机理.研究结果显示,以Fold change绝对值大于2倍进行筛选,在敏感型(GG基因型)对抗性型(AA基因型)配对组中,差异基因共13个,其中上调6个,下调7个,在以敏感型(AG基因型)对抗性型(AA基因型)配对组中,共筛选出差异基因6个,其中上调4个,下调2个.经GO分析发现差异基因的生物学过程主要涉及免疫应答、胞外区修饰(如糖基化)、细胞黏附、信号转导等.通路发现大肠杆菌F18菌株抵抗性和敏感性差异基因主要涉及糖脂合成代谢以及炎症免疫相关通路,经芯片筛选出的相关基因的功能还需进一步的研究验证.