中国壮族和裕固族群体HLAⅠ类区域Alu插入多态性及其与HLA-A位点的相关性

• 作者: 于亮 史磊 史荔 姚宇峰 孙浩 易文 杨昭庆 林克勤 褚嘉祐 陶玉芬 黄小琴
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 生物学
• 关键词: HLAⅠ类基因 Alu插入 祖先单倍型
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 页码范围: 138-146
• 分类号: Q3
• 字数: 5061字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2011.00138

摘要

近年来研究发现:位于HLAⅠ类基因区域的Alu插入是研究不同群体HLAⅠ类基因区域祖先单倍型和HLAⅠ类基因多样性产生、进化和重组的理想工具.文章对中国壮族和裕固族群体HLAⅠ类基因区域5个Alu插入多态性(AluMICB、AluTF、AluHJ、AluHG和AluHF)进行研究,结合HLA基因分型数据,分析壮族、裕固族、哈尼族、布朗族和傣族5个民族群体中Alu插入与HLA-A等位基因的关系.研究结果显示:(1)壮族和裕固族人群中5个Alu插入频率范围分别为1.5%～35.8%和9.2～34.8%,AluMICB、AluTF和Alu,HF插入频率在这两个群体中有统计学差异(P＜0.05);(2)在5个研究的群体中,AluHG插入与HLA-A*02的不同亚型关联;AluHJ插入与HLA-A*2402在5个群体中都关联,但AluHJ与HLA-A*1101和HLA-A*2407只在布朗族中关联.表明不同群体HLAⅠ类基因区域内Alu插入具有各自的特征,且Alu插入与不同的HJA-A等位基因相关联.这种Alu插入及其与HLA-A的关联特征可作为研究群体中HLAⅠ类基因和单倍型系谱变化的重要遗传标记.