用于土壤中生防芽孢杆菌B006和BH1检测的SCAR标记及其特异性

• 作者: 李世东 耿文义 许修宏 郭荣君
• 来源期刊: 中国生物防治学报
• 学科: 农学
• 关键词: SCAR分子标记 RAPD分子标记 芽孢杆菌 生物防治
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 233-240
• 分类号: S482.292|Q939.1
• 字数: 5738字
• 语种: 中文

摘要

生防芽孢杆菌Bacillus spp.菌株B006和BH1对引发多种根腐病的真菌具有拮抗作用,研发特异性标记是研究该菌株在土壤中生态行为的关键.本研究采用16个RAPD随机引物对B006和BH1以及包括芽孢杆菌、鞘氨醇杆菌Sphingosinc spp.和假单胞菌Pseudomonas spp.在内的25株参试菌株的基囚组DNA多态性进行了分析,其中利用单引物B19和C01可分别扩增到仅出现于B006和BH1基因图谱中的特异性条带(大小分别为730bp和658bp).为提高扩增的特异性和稳定性,根据B006和BH1的RAPD标记中核苷酸序列分别设计了6对和12对引物并用于菌株特异性条带的筛选,从中挑选出2对特异性最好的引物转化为SCAR引物,命名为SCAR-B006和SCAR-BH1,扩增产物大小分别为523bp和658bp.在自然土中进一步验证SCAR标记的特异性,结果表明仅在加有菌株B006或BH1的土壤样品中可扩增到相应的SCAR条带,说明了这种以PCR为基础的方法可用于土壤中菌株B006和BH1的快速鉴别.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	许修宏	东北农业大学农业资源与环境学院	126	1295	18.0	26.0