脊尾白虾微卫星富集文库的构建与多态性标记的筛选

• 作者: 刘萍 李健 潘鲁青 贾舒雯 韩智科
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 脊尾白虾 富集文库 微卫星标记 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2011,（12）
• 页码范围: 1787-1794
• 分类号: S917
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2011.17612

摘要

采用人工合成的生物素标记(AG)15探针及磁珠富集法构建了脊尾白虾基因组微卫星富集文库.将脊尾白虾基因组DNA经HaeⅢ酶切后,收集400 ～1 200 bp片段,连接特定接头,与生物素标记(AG)15探针杂交并捕获含有微卫星的DNA片段,然后连接到pMD18-T载体中,构建脊尾白虾微卫星富集文库.随机挑取947个克隆,经菌落PCR检验,其中667个为阳性克隆.从阳性克隆中随机选取184个克隆进行测序,有150个克隆含有微卫星序列,共获得199个微卫星序列,其中完美型158个(79.4％),非完美型27个(13.6％),复合型14个(7.0％).根据微卫星序列,设计了119对微卫星引物,64对扩增出稳定的具有特异性的条带,经30个脊尾白虾个体进行多样性评价后,有26个位点表现出多态性.26个微卫星位点获得的等位基因数从3 ～ 16个不等,平均每个位点扩增得到6.5个等位基因.观测杂合度(Ho)、期望杂合度(4)及多态性信息含量值(PIC)的范围分别为0.111 ～ 0.929、0.246 ～0.932、0.231 ～0.909.本研究开发的微卫星位点将为脊尾白虾种群多样性研究、家系识别和种质鉴定提供有效的工具.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘萍	中国水产科学研究院黄海水产研究所	124	3043	33.0	48.0
2	李健	中国水产科学研究院黄海水产研究所	215	3950	34.0	49.0
3	潘鲁青	中国海洋大学水产学院	102	1937	24.0	39.0
4	贾舒雯	中国海洋大学水产学院	2	29	2.0	2.0
8	韩智科	中国水产科学研究院黄海水产研究所	3	37	3.0	3.0