锦鲤疱疹病毒-CJ株ORF81基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 吕文亮 周井祥 朱霞 李新伟 王好
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 锦鲤疱疹病毒 ORF81基因 克隆测序 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2011,（12）
• 页码范围: 1780-1786
• 分类号: S917|Q785
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2011.17634

摘要

为了解锦鲤疱疹病毒中国吉林株(KHV-CJ) ORF81蛋白的结构特征和进化关系,用框镜鲤尾鳍原代细胞增殖KHV-CJ,提取其DNA,经PCR扩增,获得ORF81基因,将其克隆到pMD18-T载体中,构建重组质粒.应用生物信息学方法初步分析KHV-CJ ORF81基因的结构和功能,并与GenBank上已公布的3株KHV构建系统进化树.结果显示,获得了长771 bp的ORF81基因,编码256个氨基酸；预测ORF81基因的理论分子量为28 246.50 u,等电点为8.404；疏水性大于亲水性；信号肽切割部位最可能位于29位的S(丝氨酸)；有4个跨膜区；抗原表位预测显示抗原性良好；结构预测显示,不存在N-糖基化位点、存在6个O-糖基化位点和11个磷酸化位点；系统进化树分析显示,与锦鲤疱疹病毒以色列株属同一分支.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王好	吉林农业大学动物科技学院动物生产及产品质量安全教育部重点实验室	41	182	9.0	12.0
2	周井祥	吉林农业大学动物科技学院动物生产及产品质量安全教育部重点实验室	36	141	6.0	10.0
3	李新伟	吉林农业大学动物科技学院动物生产及产品质量安全教育部重点实验室	7	69	3.0	7.0
4	朱霞	吉林农业大学动物科技学院动物生产及产品质量安全教育部重点实验室	9	69	3.0	8.0
5	吕文亮	吉林农业大学动物科技学院动物生产及产品质量安全教育部重点实验室	7	72	3.0	7.0