贵州省3株钩端螺旋体分离株PFGE分型与基因种鉴定

• 作者: 于春 刘英 唐光鹏 张翠彩 李世军 李秀文 田克成 聂一新 蒋秀高 蔡星和
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 钩端螺旋体 PFGE 16S rRNA 序列分析 同源性 基因种
• 年，卷（期）: 2011,（7）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 587-591
• 分类号: R378.5
• 字数: 3460字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2011.07.002

摘要

目的 应用脉冲场电泳(PFGE)分型技术和16S rRNA基因测序分析技术分别对贵州省3株动物宿主钩端螺旋体分离菌株进行分子分型和基因种鉴定,了解贵州省钩端螺旋体的分子流行病学特征.方法 应用DNA限制性内切酶Not I对钩端螺旋体染色体DNA酶切后,用PFGE将DNA片段分离,采用BionumericsV4.0将3株钩体菌株PFGE图谱与中国15群15型参考菌株进行聚类分析;同时,应用PCR扩增几乎全长的钩体16S rRNA基因片段,并将扩增产物进行双向序列测定,并与GenBank数据库已注册的核酸序列进行同源性比对、确定基因种、分析亲缘进化关系.结果 来自贵州省的3株动物宿主分离钩体菌株PFGE带型命名为LepNot I 002和LepNot I 003,经聚类分析,3株菌株与黄疸出血群黄疸出血型赖株的相似性大于95%.16S rRNA基因测序和分析表明,3株贵州分离钩体菌株之间的同源性为100%,与致病性钩体问号钩端螺旋体种(L.interrogans)不同血清型参考菌株的同源性达100%.结论 3株贵州动物分离钩体菌株经PFGE分型鉴定与黄疸出血群赖型赖株的相似性大于95%,经16S rRNA基因测序分析鉴定为L.interrogans种,上述两种方法对贵州省钩体分离菌株的鉴定结果一致,有助于贵州省钩端螺旋体病的主动监测、暴发调查和传染源追踪.