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稻瘟病菌菌株FJ81278中新发现的一个基因注释及其表达分析
稻瘟病菌菌株FJ81278中新发现的一个基因注释及其表达分析
作者:
王宗华
王宝华
王杏杏
翟焕趁
连壁
鲁国东
原文服务方:
《福建农林大学学报(自然科学版)》
稻瘟病菌
疏水表面结合蛋白A
转录组
表达分析
摘要:
对稻瘟病菌菌株FJ81278进行基因组和转录组分析,发现一个新的特异基因MoHsbA编码的蛋白具有疏水表面结合蛋白A(HsbA)结构域和一个信号肽.进一步的生物信息学分析发现,该基因组中另外7个基因编码的蛋白也具疏水表面结合蛋白结构域.稻瘟病菌中的HsbA蛋白聚集于系统发育树的同一个大的分支上,说明它们具有较近的亲缘关系.转录组和EST数据库中HsbA的表达情况不同,但在菌株GUY11侵染阶段基因芯片中均表现为上调.实时定量PCR分析表明,MoHsbA在菌株FJ81278不同生长发育阶段均有表达,但在附着胞阶段表达量相对较高,推测该基因与附着胞的形成相关.研究结果为进一步揭示稻瘟病菌HsbA的生物学功能奠定了基础.
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内容分析
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(/年)
文献信息
篇名
稻瘟病菌菌株FJ81278中新发现的一个基因注释及其表达分析
来源期刊
《福建农林大学学报(自然科学版)》
学科
关键词
稻瘟病菌
疏水表面结合蛋白A
转录组
表达分析
年,卷(期)
2011,(6)
所属期刊栏目
植物保护
研究方向
页码范围
570-575
页数
分类号
Q933
字数
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王宝华
福建农林大学植物保护学院
8
100
4.0
8.0
2
鲁国东
福建农林大学植物保护学院
72
538
13.0
21.0
3
王宗华
福建农林大学生命科学学院
74
760
17.0
25.0
7
翟焕趁
福建农林大学生命科学学院
5
66
3.0
5.0
8
连壁
福建农林大学计算机与信息学院
1
3
1.0
1.0
9
王杏杏
福建农林大学植物保护学院
1
3
1.0
1.0
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版权信息
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稻瘟病菌
疏水表面结合蛋白A
转录组
表达分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
《福建农林大学学报(自然科学版)》
主办单位:
福建农林大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1671-5470
CN:
35-1255/S
开本:
大16开
出版地:
福建省福州市仓山区上下店路15号
邮发代号:
创刊时间:
1953-01-01
语种:
中文
出版文献量(篇)
2891
总下载数(次)
0
总被引数(次)
30358
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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《福建农林大学学报(自然科学版)》2011年第2期
《福建农林大学学报(自然科学版)》2011年第5期
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