中国流行的狂犬病病毒时空进化分析

• 作者: 严家新 吴杰 孟胜利 徐葛林 杨晓明 雷永良
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 狂犬病病毒 分子流行病 N基因 地理 中国 生物信息学
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 231-237
• 页数: 7页
• 分类号: R373.9
• 语种: 中文

摘要

本研究对1931～2009年间分离于中国20个省区的167株狂犬病病毒的N基因序列进行进化分析,以探讨中国狂犬病病毒株的基因分型和分组情况、时间和空间的动态进化.结果显示:从中国分离的毒株都属于基因1型狂犬病病毒,可以分为2个进化分支共计8个组,分支I包括1～4组,分支Ⅱ包括5～8组;选择压力分析表明中国狂犬病病毒处于较强的净化选择约束下,狂犬病病毒N基因中的核苷酸突变主要是同义突变;运用贝叶斯中的马尔科夫链的蒙特卡洛方法估计中国狂犬病病毒N基因核苷酸的平均碱基替代率为4×10-4替代/位点/年,共同祖先出现的时间不超过2000年前;迁移分析表明中国狂犬病病毒株存在跨地域传播.