基于功能域组分的蛋白质折叠类型识别

• 作者: 徐海松 李晓琴 闫金丽 陈治伟
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 学科: 化学
• 关键词: 折叠类型 折叠识别 功能域 LIFCA数据库
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 页码范围: 166-172
• 页数: 7页
• 分类号: Q615|Q518|O629.7
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1206.2010.00345

摘要

蛋白质空间结构研究是分子生物学、细胞生物学、生物化学以及药物设计等领域的重要课题.折叠类型反映了蛋白质核心结构的拓扑模式,对折叠类型的识别是蛋白质序列与结构关系研究的重要内容.选取LIFCA数据库中样本量较大的53种折叠类型,应用功能域组分方法进行折叠识别.将Astral 1.65中序列一致性小于95%的样本作为检验集,全库检验结果中平均敏感性为96.42%,特异性为99.91%,马修相关系数(MCC)为 0.91,各项统计结果表明:功能域组分方法可以很好地应用在蛋白质折叠识别中,LIFCA相对简单的分类规则可以很好地集中蛋白质的人部分功能特性,反映了结构与功能的对应关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李晓琴		28	71	5.0	6.0
2	徐海松		9	39	3.0	5.0
3	陈治伟		2	6	1.0	2.0
4	闫金丽		1	0	0.0	0.0