利用ARIMA模型对木聚糖酶F/10和G/11的进化过程分析

• 作者: 朱平 王伟
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 工学
• 关键词: 木聚糖酶 ARIMA模型 同义密码子
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 37-40
• 分类号: O29|TP301|Q71
• 字数: 2716字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-311X.2011.01.013

摘要

目的:利用ARIMA模型对木聚糖酶(Xylanase)F/10和G/11家族的进化过程进行分析,并分析两家族中同时含量较高的氨基酸在进化中的特征.方法:计算出每条序列中均含量较高的几种氨基酸,利用SAS时间序列中的ARIMA模型,选取木聚糖酶F/10和G/11两个家族的各十条进化阶段不同的序列,设计一个时间序列实验进行分析.结果:F/10家族的进化是平稳的,甘氨酸含量逐渐降至7%左右,缬氨酸的含量稳定的保持在7%上下,而G/11家族的进化存在较大波动,甘氨酸含量升至14%左右,丙氨酸含量相对于F/10家族稳定.结论:F/10家族的进化比G/11家族稳定,甘氨酸在两家族进化存在明显差异,这对研究木聚糖酶分子的进化以及同义密码子的偏好性具有一定的指导意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱平	江南大学理学院	60	186	7.0	12.0
2	王伟	江南大学理学院	57	405	11.0	18.0