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摘要:
采用PCR扩增测序法获得了棘头梅童鱼Collichtys iucidus南通、启东、芦潮港、温州、瑞安、福州、番禺7个地理群体53尾鱼的mtDNA控制区全序列.棘头梅童鱼控制区序列长度为778~782 bp,序列长度变异主要是由位点的插入或缺失造成,识别了终止序列区TAS和保守序列区CSB1、CSB2、CSB3序列.共检测到多态位点66个,占全部序列的8.44%,检测到单倍型33种,平均单倍型多样性(Hd)为0.934 7±0.017 5,平均核苷酸多样性(π)为0.017 5±0.002 3.棘头梅童鱼群体内的遗传距离(K 2-P)为0.001 7~0.022 8,群体间的遗传距离为0.002 3~0.043 3,群体间的分化指数FsT为-0.058 4~0.845 8,基因流为0.05~19.62.AMOVA分析结果显示,群体间的变异为74.21%,群体内的变异为25.79%(P<0.05),表明群体间发生了显著的遗传分化.以NJ法构建的亲缘关系树显示,棘头梅童鱼7个群体分为两个大支,一支以北方类群(南通、启东、芦潮港、温州群体)个体为主,另一支以南方类群(福州和番禹群体)个体为主,而位于南、北方类群中间位置的瑞安群体则与两大类群均有交叉.
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文献信息
篇名 棘头梅童鱼线粒体控制区的序列变异与群体遗传结构
来源期刊 渔业科学进展 学科 农学
关键词 棘头梅童鱼 群体遗传结构 线粒体控制区 序列
年,卷(期) 2011,(2) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 34-40
页数 分类号 S931.5
字数 3782字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1000-7075.2011.02.006
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 郑德锋 2 40 2.0 2.0
2 赵金良 2 40 2.0 2.0
3 周文玉 31 137 7.0 10.0
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节点文献
棘头梅童鱼
群体遗传结构
线粒体控制区
序列
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相关学者/机构
期刊影响力
渔业科学进展
双月刊
1000-7075
37-1466/S
大16开
山东省青岛市南京路106号(黄海水产研究所)
24-153
1980
chi
出版文献量(篇)
2367
总下载数(次)
4
总被引数(次)
28561
相关基金
上海市科技兴农重点攻关项目
英文译名:
官方网址:http://www.xmgl.org/dl_download.htm
项目类型:
学科类型:
论文1v1指导