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棘头梅童鱼线粒体控制区的序列变异与群体遗传结构
棘头梅童鱼线粒体控制区的序列变异与群体遗传结构
作者:
周文玉
赵金良
郑德锋
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
棘头梅童鱼
群体遗传结构
线粒体控制区
序列
摘要:
采用PCR扩增测序法获得了棘头梅童鱼Collichtys iucidus南通、启东、芦潮港、温州、瑞安、福州、番禺7个地理群体53尾鱼的mtDNA控制区全序列.棘头梅童鱼控制区序列长度为778~782 bp,序列长度变异主要是由位点的插入或缺失造成,识别了终止序列区TAS和保守序列区CSB1、CSB2、CSB3序列.共检测到多态位点66个,占全部序列的8.44%,检测到单倍型33种,平均单倍型多样性(Hd)为0.934 7±0.017 5,平均核苷酸多样性(π)为0.017 5±0.002 3.棘头梅童鱼群体内的遗传距离(K 2-P)为0.001 7~0.022 8,群体间的遗传距离为0.002 3~0.043 3,群体间的分化指数FsT为-0.058 4~0.845 8,基因流为0.05~19.62.AMOVA分析结果显示,群体间的变异为74.21%,群体内的变异为25.79%(P<0.05),表明群体间发生了显著的遗传分化.以NJ法构建的亲缘关系树显示,棘头梅童鱼7个群体分为两个大支,一支以北方类群(南通、启东、芦潮港、温州群体)个体为主,另一支以南方类群(福州和番禹群体)个体为主,而位于南、北方类群中间位置的瑞安群体则与两大类群均有交叉.
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文献信息
篇名
棘头梅童鱼线粒体控制区的序列变异与群体遗传结构
来源期刊
渔业科学进展
学科
农学
关键词
棘头梅童鱼
群体遗传结构
线粒体控制区
序列
年,卷(期)
2011,(2)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
34-40
页数
分类号
S931.5
字数
3782字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1000-7075.2011.02.006
五维指标
作者信息
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姓名
单位
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郑德锋
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赵金良
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3
周文玉
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传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
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共引文献
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节点文献
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节点文献
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线粒体控制区
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研究来源
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期刊影响力
渔业科学进展
主办单位:
中国水产学会
中国水产科学研究院黄海水产研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-7075
CN:
37-1466/S
开本:
大16开
出版地:
山东省青岛市南京路106号(黄海水产研究所)
邮发代号:
24-153
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
2367
总下载数(次)
4
总被引数(次)
28561
相关基金
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英文译名:
官方网址:
http://www.xmgl.org/dl_download.htm
项目类型:
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