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摘要:
文章根据已报道的硬骨鱼类hepcidin cDNA序列设计简并引物,通过RT-PCR从重要海水经济鱼类斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)肝脏中扩增出1条具有完整开放阅读框的246 bp cDNA序列,Blast分析表明该序列是鱼类hepcidin基因家族的一员,被命名为斜带石斑鱼hepcidin样抗菌肽前体,该cDNA所推导的氨基酸序列有如下特点:1)信号肽序列与多数鱼类hepcidin信号肽的同源性在67%~87%之间;2)C端20个氨基酸序列具有绝大多数动物hepcidin成熟肽的共同典型保守序列特征,即在对应位置具有8个Cys;3)序列中不具有已报道的hepcidin前体肽转化酶作用典型基序[RX(K/R) R];4)与GenBank中已注册的2条斜带石斑鱼hepcidin cDNA序列(GU391241和GU391242)所推导的氨基酸序列同源性分别为36%和33%,且NJ进化树显示不与这2条序列聚为一枝,表明该序列是斜带石斑鱼hepcidin基因家族中一种新亚型,其预测成熟肽融合表达载体成功在大肠杆菌(Escherichia coli)中表达,为后续研究奠定基础.
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文献信息
篇名 斜带石斑鱼抗菌肽hepcidin基因克隆及其成熟肽的原核融合表达
来源期刊 南方水产 学科 生物学
关键词 斜带石斑鱼 抗菌肽 hepcidin 分子克隆 原核融合表达
年,卷(期) 2011,(1) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 1-7
页数 分类号 Q516
字数 4506字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.2095-0780.2011.01.001
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 刘志刚 深圳大学生命科学学院 324 1724 17.0 23.0
2 邓利 深圳大学生命科学学院 22 200 10.0 13.0
3 陈大玮 深圳大学生命科学学院 7 61 5.0 7.0
4 马一见 深圳大学生命科学学院 2 17 2.0 2.0
5 孟铂渊 深圳大学生命科学学院 1 13 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
斜带石斑鱼
抗菌肽
hepcidin
分子克隆
原核融合表达
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
南方水产科学
双月刊
2095-0780
44-1683/S
大16开
广州市新港西路231号
46-65
1963
chi
出版文献量(篇)
1477
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