香蕉根系均一化全长cDNA文库的构建和鉴定

• 作者: 徐碧玉 殷晓敏 王卓 王家保 金志强
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 香蕉 根系 均一化 cDNA文库 基因 表达
• 年，卷（期）: 2011,（9）
• 所属期刊栏目: 果树
• 页码范围: 1667-1674
• 分类号: S668.1
• 语种: 中文

摘要

以香蕉幼苗根系为材料,利用DSN（duplex-specific nuclease）均一化技术与SMART（switching mechanismat5′end of RNA transcript）技术相结合,构建香蕉根系均一化全长cDNA文库。经检测,初级文库滴度1.1×106cfu·mL-1,库容5×106个独立克隆,重组率大于95%,插入片段平均长度大于1kb,表明文库质量较好。随机挑取192个克隆进行EST（expressed sequencetags）测序,成功获得179个高质量EST,含5个conting和174个singlet,冗余度仅为2.35%。小规模测序拼接后获得145个unigenes,对unigenes分析结果表明文库的可靠性好。从序列比对结果中挑选3个与其它植物同源的抗逆基因,利用RT-PCR方法进行了干旱、低温及盐胁迫条件下基因表达分析,结果显示这3个基因在不同的逆境下差异表达。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王家保	中国热带农业科学院环境与植物保护研究所	79	691	14.0	22.0
2	徐碧玉	中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带生物技术重点开放实验室	96	1042	20.0	28.0