基于线粒体cox1基因部分序列对青南高原地区称多、达日、玛沁3县高原鼠兔感染的20份棘球绦虫幼虫(棘球蚴)样品进行分子鉴定和遗传分化分析.在测序获得的700 bp长度序列中检测到17个变异位点,其中11个为简约信息位点.共检测到9个单倍型,最大简约法和最大似然法都表明这些单倍型都属于石渠棘球绦虫.遗传距离和聚类分析显示,称多和达日种群遗传距离最近,而玛沁种群与称多、达日以及首次报道的石渠县样本的遗传关系较远,此外玛沁种群的遗传多样性要高于其他2个种群,推测玛沁地区可能是青南地区石渠棘球绦虫的起源地之一.单倍型谱系关系分析显示,所有单倍型以及之前报道(Xiao et al.,2005)的石渠县样本以H1为中心形成辐射状结构,这与前人的研究结论即石渠棘球绦虫单倍型呈现链状结构相反,显示出石渠棘球绦虫遗传分化规律的复杂性.