禽波氏杆菌外膜蛋白A的克隆测序与生物信息分析

• 作者: 孙振红 朱瑞良 王慧 王新建 盛鹏程 谭燕玲 魏凯
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 禽波氏杆菌 外膜蛋白A 二级结构 B细胞抗原表位 预测
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 544-550
• 分类号: S852.61
• 字数: 3615字
• 语种: 中文

摘要

本文旨在克隆禽波氏杆菌外膜蛋白OmpA的编码基因,并预测OmpA蛋白二级结构和B细胞抗原表位,从而探讨禽波氏杆菌外膜蛋白OmpA在免疫保护中所起的作用.作者对禽波氏杆菌的外膜蛋白ompA基因进行PCR扩增、克隆及序列测定.应用生物信息学相关软件和方法,对禽波氏杆菌OmpA蛋白的二级结构和B细胞抗原表位进行预测.禽波氏杆菌ompA基因全长597 bp,编码199个氨基酸.二级结构以无规卷曲为主,有少量的α-螺旋和β-片层,少见β-转角;推测OmpA蛋白有5个B细胞优势抗原表位区域、2个糖基化位点.本研究为进一步分析禽波氏杆菌免疫机理、制备单克隆抗体和设计表位疫苗等奠定理论基础.