火红熊蜂微卫星标记的筛选及种特异性分析

• 作者: 周冰峰 安建东 董捷 黄家兴
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 熊蜂 火红熊蜂 分子标记 微卫星标记 磁珠富集 引物设计 种特异性
• 年，卷（期）: 2011,（12）
• 所属期刊栏目: 进化与系统学
• 页码范围: 1423-1432
• 分类号: Q968
• 语种: 中文

摘要

火红熊蜂Bombus pyrosoma是中国特有的熊蜂资源,在华北地区分布十分丰富,是众多野生植物和农作物的重要传粉者.为了探究火红熊蜂的遗传结构及其进化关系,首次开展了该种熊蜂卫星标记的筛选及其种特异性研究.本研究采用生物素-磁珠吸附分离法从火红熊蜂基因组中筛选微卫星标记,并选取黑熊蜂亚属Melanobombus其他7种熊蜂进行了这些标记的种特异性验证.结果表明:不同探针与磁珠杂交产生的微卫星标记阳性克隆率存在很大差异,TC探针的微卫星阳性克隆率最高为82％；TG探针次之,为28％；AT和GC探针分离未获得微卫星标记克隆.根据获得的阳性克隆的序列设计引物进行筛选验证,共获得31对熊蜂微卫星序列特异性引物.微卫星标记分析发现,完美型(perfect) 18个,占58.1％；非完美型(imperfect)10个,占32.3％；混合完美型(compound perfect)1个,占3.2％；混合非完美型(compound imperfect)2个,占6.4％.不同探针的微卫星核心序列重复数不同,TC探针和TG探针的微卫星核心序列最高重复数分别为28和15个,最低重复数分别为7和11个.利用所获得的31对微卫星引物对黑熊蜂亚属其他7种熊蜂进行检测,有26对引物可以扩增所测试的7种熊蜂,其他5对引物只能扩增部分熊蜂种类,其中BPM5是火红熊蜂种特异性引物.本研究从火红熊蜂基因组中筛选的微卫星标记,不仅可用于火红熊蜂的遗传结构、分子进化和资源保护等方面的研究,而且可进一步用于黑熊蜂亚属其他种群的遗传特性分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	董捷	中国农业科学院蜜蜂研究所	91	1093	19.0	27.0
2	安建东	福建农林大学蜂学学院	76	1188	21.0	30.0
4	周冰峰	福建农林大学蜂学学院	46	265	11.0	13.0
5	黄家兴	中国农业科学院蜜蜂研究所	46	482	13.0	20.0