甲型流感病毒HA基因的简单重复序列分布分析

• 作者: 彭军 易丽萍 蔡立军 谭钟扬 赵相艳
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 医学
• 关键词: 甲型流感 简单重复序列 血凝素
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 54-59
• 分类号: R371.13
• 字数: 3954字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2011.01.014

摘要

以GenBank公开的甲型流感病毒亚型的血凝素(hemagglutinin,HA)核苷酸序列为材料,从简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分布的分析角度出发,分析了来自于亚洲、非洲、北美洲、南美洲、欧洲、大洋洲的49个地区的76株甲流病毒的HA片段.分析表明:所分析序列的SSRs的分布都很相似,其中单碱基重复的相对丰度值和相对密度值均高于其它五种碱基重复的相对丰度值和相对密度值;甲流病毒HA片段的SSRs与HIV-1[16]基因中的SSRs相比,前者的相对丰度值和相对密度值高于后者.这些结果表明甲流病毒基因中的SSRs可能与甲流病毒的快速变异相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蔡立军		37	352	9.0	18.0
2	彭军		15	57	4.0	6.0
3	谭钟扬		12	21	3.0	4.0
4	易丽萍		6	24	3.0	4.0
5	赵相艳		4	12	2.0	3.0