肠出血性大肠埃希菌O157:H7紧密黏附素C300与LTB融合蛋白B细胞表位预测

• 作者: 姜岩硕 崔莎莎 徐松宝 李明成
• 来源期刊: 北华大学学报（自然科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 肠出血性大肠埃希菌 紧密黏附素C300 融合蛋白 B细胞识别表位
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 生物科学·基础医学
• 页码范围: 296-299
• 分类号: R285.5
• 字数: 2037字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-4822.2011.03.011

摘要

目的 对肠出血性大肠埃希菌O157:H7紧密黏附素C300与黏膜佐剂不耐热肠毒素(LTB)融合蛋白二级结构及B细胞识别表位进行预测,为开发新型疫苗提供理论依据.方法 采用DNA star软件中的Protean预测软件对Intimin C300与LTB融合蛋白的亲水性指数、β-转角、柔韧性、表面可及性和抗原指数进行预测.结果 在融合蛋白N端第1-10、20-30、110-120、210-220、300-310、350-360、380-390和415-420区段可能是α-螺旋中心,在N端第195-205、300-320、335-350和390-410区段形成4个大的β-折叠中心区域,在各β-折叠区间存在均匀且较丰富的转角区域.融合蛋白的蛋白柔性区域可能位于N端第20-35、52-65、75-85、105-115、150-160、172-188、260-275和372-388区域,这些区域有一定幅度的折叠或摆动,可形成较复杂的三级结构.亲水性区域位于第50-60、70-80、155-165、190-200、240-250、270-270、330-340和375-385区段,这8个区域作为抗原表位可能性大.结论 通过生物信息学技术分析,可有效地预测融合蛋白二级结构和B细胞表位,为人工合成优势肽段进行肠出血性大肠埃希菌O157:H7的重组疫苗研制提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李明成	北华大学医学检验学院	75	244	7.0	12.0
2	崔莎莎	北华大学医学检验学院	1	3	1.0	1.0
3	姜岩硕	北华大学医学检验学院	1	3	1.0	1.0