新型鸭肝炎病毒GD1株VP1结构蛋白的基因分析及B细胞抗原表位预测

• 作者: 曹瑞兵 杜佳慧 范卫国 陈溥言
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 新型鸭肝炎病毒 VP1蛋白 序列分析 B细胞表位
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 65-68
• 分类号: S852.65
• 字数: 2923字
• 语种: 中文

摘要

对新型鸭肝炎病毒(DHV)GD1 株 VP1 结构蛋白基因进行了扩增、克隆及序列测定.采用DNAStar Protean软件对VP1蛋白的二级结构、可塑性、亲水性、表面可能性及抗原指数等参数进行分析,综合预测其B细胞表位分布.结果表明,VP1基因长720 bp,编码240个氨基酸.与国内和韩国分离的新型毒株的氨基酸序列相似性最高,分别为99.6%,92.9%和92.5%.与台湾新型DHV的序列相似性均较低,分别为80.6%,80.2%,与传统的Ⅰ型DHV毒株的序列相似性最低,相似度仅为25.5%.较1型DHV存在多个氨基酸的插入和较多氨基酸位点的突变,高变区主要集中在180～220位.VP1结构蛋白的二级结构较为复杂,含有较多的β片层结构和转角结构,有多个区域为B细胞优势表位.该方法预测的B细胞表位结果有较高的准确度,为试验确定新型DHV毒株的VP1结构蛋白的B细胞表位和新的多表位疫苗设计提供了理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈溥言	南京农业大学动物医学院	269	2875	28.0	40.0
2	曹瑞兵	南京农业大学动物医学院	71	897	19.0	28.0
3	范卫国	南京农业大学动物医学院	3	48	2.0	3.0
4	杜佳慧	南京农业大学动物医学院	2	47	2.0	2.0