斐豹蛱蝶线粒体基因组全序列的测定和分析

• 作者: 孙倩倩 孙晓燕 张大秀 杨群 王晓灿 胡静 郝家胜
• 来源期刊: 动物学研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 斐豹蛱蝶 蛱蝶科 鳞翅目 线粒体基因组
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 465-475
• 分类号: Q969.42|Q969.439.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1141.2011.05465

摘要

该研究对斐豹蛱蝶(Argyreus hyperbius)(鳞翅目:蛱蝶科)线粒体基因组全序列进行了测定和初步分析.结果表明:斐豹蛱蝶线粒体基因全序列全长为15156bp,包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA和2个rRNA基因以及1个非编码的A+T富集区,基因排列顺序与其它鳞翅目种类一致;线粒体全序列核苷酸组成和密码子使用显示出明显的A+T偏好(80.8％)和轻微的AT偏移(AT skew,-0.019).基因组中共存在11个2～52bp不等的基因间隔区,总长96 bp;以及14个1～8 bp不等的基因重叠区,总长34 bp.除COl以CGA作为起始密码子外,13个蛋白质编码基因中的其余12个基因是以ATN作为起始密码子.除COI和COⅡ基因是以单独的一个T为终止密码子,其余11个蛋白质编码基因都是以TAA结尾的.除了缺少DHU臂的tRNAScr(AGN),其余的tRNA基因都显示典型的三叶草结构.tRNA (AGN)和ND1之间的基因间隔区包含一个ATACTAA结构域,这个结构域在鳞翅目中是保守的.A+T富集区没有较大的多拷贝重复序列,但是包含一些微小重复结构:ATAGA结构域下游的20 bp poly-T结构,ATTTA结构域后的(AT)9重复,以及位于tRNAMet上游的5 bp poly-A结构等.这项研究所揭示的斐豹蛱蝶的线粒体基因组特征,不仅为认识蛱蝶科的遗传多样性贡献数据,而且对于该物种的保护生物学、群体遗传学、谱系地理及演化研究等具有重要意义.