番红花EST资源的SSR信息分析

• 作者: 陈国庆
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: 番红花 药用植物 EST EST-SSR 微卫星
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 43-46,96
• 分类号: Q75
• 字数: 3187字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-3142.2011.01.010

摘要

从NCBI公共数据库下载得到6745条番红花EST,通过前处理得到全长为612.01 kb的无冗余EST 1431条.在这些序列中搜索出108个SSR,分布于103条EST中,出现频率为7.55%.这些EST-SSR的平均分布距离是5.67 kb.二核苷酸重复和三核苷酸重复是番红花主要的重复类型,分别占总EST-SSR的30.56%和37.96%.AG/CT和AAG/CTT是二、三核苷酸重复中的优势基元,分别占二、三核苷酸重复的66.67%和29.27%.本研究为番红花EST-SSR标记的建立和进一步应用奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈国庆	湖北师范学院生命科学学院	3	20	2.0	3.0