牛Gtl2基因cDNA序列分析及启动子预测

• 作者: 侯晓慧 李世杰 苏红
• 来源期刊: 河北农业大学学报
• 关键词: 牛Gtl2基因 生物信息学分析 启动子 转录因子结合位点
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 页码范围: 75-80
• 分类号: Q38|Q341
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-1573.2011.04.015

摘要

利用RT-PCR和RACE方法,克隆得到了牛Gtl2基因cDNA全序列,生物信息学分析表明:该序列有8个外显子,含有一个最长645 bp的开放读码框,但没有发现与Kozak规则相匹配的翻译起始序列.Gtl2基因在物种间具有保守性,尤其是第1个外显子表现出了较强的保守性.基因进化树分析表明,牛Gtl2基因与绵羊Gtl2基因的亲缘关系最近.使用启动子预测,在线软件对牛Gtl2基因的5'侧翼序列进行分析,得出了潜在的启动子区域,这些区域含有TATA,CAAT框和GC框,并存在一些转录因子结合位点,而且在5'侧翼区域发现有3个CpG岛.转录因子结合位点和CpG岛可能与牛Gtl2基因的转录及其表达调控有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李世杰	河北农业大学生命科学学院	36	214	7.0	13.0
2	苏红	河北农业大学生命科学学院	15	40	4.0	5.0
3	侯晓慧	河北农业大学生命科学学院	2	7	2.0	2.0