鹿角菜18S rDNA序列分析及其系统发生分析

• 作者: 丁刚 刘玮 吴海一 李美真 詹冬梅
• 来源期刊: 烟台大学学报（自然科学与工程版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 鹿角菜 18S rDNA 转录因子 系统发生
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 48-53
• 分类号: Q78
• 字数: 3330字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-8820.2011.01.011

摘要

通过制备鹿角菜DNA,PCR扩增得到鹿角菜18S rDNA序列.测序拼接后全长1733 bp,碱基A、T、C、G含量分别为25.45%、26.72%、26.72%、21.12%,序列已提交Gene Bank登录号为GQ433994.该序列与NCBI数据库中其他褐藻18S rDNA序列比对后,得到可变碱基位点184个,简约信息位点161个,单碱基变化位点23个.转换碱基值Si为44,颠换碱基值Sv为30,转换颠换比值R约为1.5.NJ法构建的系统发生树显示18S rDNA在褐藻门中具有保守性,可用于辅助传统分类.PLACE数据库预测发现在鹿角菜18S rDNA保守区有多个与水分胁迫、光诱导、Ca2+信号传导等相关转录元件,这表明18S rDNA可能参与细胞重要调控途径.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李美真	山东省海水养殖研究所藻类中心实验室	42	516	14.0	22.0
2	吴海一	山东省海水养殖研究所藻类中心实验室	41	201	9.0	13.0
3	丁刚	山东省海水养殖研究所藻类中心实验室	36	225	8.0	14.0
4	刘玮	山东省海水养殖研究所藻类中心实验室	25	104	5.0	9.0
5	詹冬梅	山东省海水养殖研究所藻类中心实验室	33	254	8.0	15.0