PRRSV分离株Nsp2基因和ORF5基因的遗传变异分析

• 作者: 丛晓燕 刘杰 吴家强 孙建全 张金强 时建立 李俊 王剑非 迟小伟
• 来源期刊: 家畜生态学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒 分离 Nsp2基因 ORF5基因 变异分析
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 48-53
• 分类号: S811.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-1182.2011.01.012

摘要

为了解山东省PRRSV流行毒株的遗传变异情况和分子流行病学背景,对2007～2009年分离到的14株山东省内的PRRSV流行毒株进行了Nsp2和ORF5基因序列的测定和分析.结果显示,与参考毒株JXA1相比,14株PRRSV Nsp2与ORF5基因的核苷酸同源性分别达到96.1%～99.8%和98.0%～99.8%,氨基酸序列同源性分别达到92.9%～100%和97.5%～99.5%.序列分析结果表明,14株毒株在Nsp2蛋白内部均存在编码30个氨基酸的碱基对的不连续缺失;ORF5基因编码的GP5蛋白不存在缺失,但存在点突变.遗传进化分析表明,07年分离毒株JQ与参考毒株JXA1亲缘关系很近;09年分离的12株PRRSV,2株仍与国内2006～2007年间的分离株在同一分支,9株已经处在不同分支,1株单独处在一个分支.2007～2009年山东地区流行的PRRSV分离株具有年度特征,无明显的地域特征.