水稻HKT基因家族密码子使用特性分析

• 作者: 杨平
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: 水稻 HKT基因家族 密码子
• 年，卷（期）: 2011,（11）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 1137-1140,1145
• 分类号: S511
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2011.11.01

摘要

运用CodonW程序对水稻HKT基因家族密码子组成、同义密码子使用频率和全长编码区密码子使用各项参数进行计算和统计分析.结果表明:密码子适应指数(CAI值)与最优密码子使用频率(FOP)、密码子偏爱指数(CBI)均呈极显著正相关(P＜ 0.01)；有效密码子数(ENC)与同义密码子第3位碱基含量(C3s,G3s)、最优密码子使用频率(FOP)、密码子偏爱指数(CBI)、GC含量、GC3s均呈极显著负相关(P＜ 0.01).水稻HKT基因家族密码子使用的相对频率(RSCU)值＞1的密码子多以G或C结尾.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨平		49	163	7.0	10.0