大鼠肠内容物细菌基因组DNA提取方法的比较

• 作者: 周莎桑 宋晓明 应华忠 戴方伟 李长龙 柯贤福 萨晓婴
• 来源期刊: 中国实验动物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 实验动物 肠内容物 细菌 DNA提取方法
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 246-249
• 分类号: Q95-33
• 字数: 3414字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-4847.2011.03.015

摘要

目的 比较两种肠内容物前处理和两种提取方法对清洁级SD大鼠肠内容物细菌基因组DNA提取效率.方法 分别选用PBS多次离心漂洗、液氮破细胞两种前处理方法和酚/氯仿抽提、试剂盒过柱法两种提取方法进行组合分析,对4份肠内容物和16份含金黄色葡萄球菌肠内容物进行随机提取.结果 大鼠肠内容物细菌基因组DNA含量和纯度测定结果显示,与PBS反复离心相比,液氮研磨前处理能显著提高大鼠肠内容物基因组DNA.荧光定量PCR表明,液氮研磨前处理较PBS反复离心能更好地收集细菌基因组DNA,其Ct值最低.结论 研究结果表明,采用液氮研磨试剂盒法在大鼠肠内容物DNA提取中是较为优良的方法,该方法为建立实验动物中微生物的定量PCR检测方法打下了基础.