β-苦瓜素的结构分析与表位预测

• 作者: 冉华全 周小东 曾照芳
• 来源期刊: 激光杂志
• 学科: 工学
• 关键词: β-苦瓜素 信号肽 细胞毒性T细胞表位 B细胞抗原表位
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 所属期刊栏目: 激光医学与医学(论文与临床报告)
• 页码范围: 84-86
• 分类号: TN248.1
• 字数: 3640字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0253-2743.2011.01.041

摘要

采用佳物信息学方法、神经网络算法、量化矩阵法和隐式马尔可夫模型,分析β-苦瓜素蛋白的空间结构,预测其信号肽、B细胞抗原表位、细胞毒性T细胞表位、主要组织相容性复合物分子结合肽,对β-占瓜素蛋白序列作预测打分.得出β-苦瓜素启始部有一段22个氨基酸构成的信号肽,分布着6个B细胞表位,3个CTL表位,序列71-79的HLA限制性CTL表位结合力最高,3段共有MHC-Ⅰ类分子结合肽,2段共有MHC-Ⅱ类分子结合肽.可为研究β-苦瓜素凋控免疫、抗癌机理提供依据.