森林草莓精氨酸脱羧酶基因的电子克隆与序列分析

• 作者: 吴伟民 王壮伟 王静 赵密珍 钱亚明
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 森林草莓 ADC基因 电子克隆 生物信息学 RT-PCR
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 628-633
• 分类号: Q78
• 字数: 4023字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2011.03.030

摘要

从森林草莓中分离精氨酸脱羧酶基因(FvADC),分析其表达模式、序列特征和进化关系。采用电子克隆结合RT-PCR分离FvADC；半定量RT-PCR检测其在盐、热、冷胁迫下的表达情况；生物信息学分析FvADC的结构与进化。结果获得FvADC cDNA全长，包括2 154 bp的编码区，RT-PCR验证编码区序列与电子克隆序列一致；FvADC基因编码的精氨酸脱羧酶与桃、苹果和海棠的同源性分别达87％、94％和83％，含信号肽，具有2个保守的氨基酸结构域：ADC家族2磷酸吡哆醛结合位点和ADC家族2标记2序列；进化分析表明森林草莓精氨酸脱羧酶与苹果、桃精氨酸脱羧酶关系最近；半定量RT-PCR证实FvADC在盐、热、冷胁迫下诱导表达。以上结果说明电子克隆能用于草莓基因的分离，而FvADC可作为逆境候选基因用于草莓遗传改良。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵密珍	江苏省农业科学院园艺研究所	123	1382	20.0	32.0
2	钱亚明	江苏省农业科学院园艺研究所	86	862	15.0	26.0
3	吴伟民	江苏省农业科学院园艺研究所	85	595	14.0	19.0
4	王静	江苏省农业科学院园艺研究所	32	419	11.0	19.0
5	王壮伟	江苏省农业科学院园艺研究所	60	460	12.0	19.0